centos rstudio(centos现在哪个版本最流行)

CentOS服务器网页版Rstudio-server及R包批量安装最佳实践

CentOS服务器网页版Rstudio-server及R包批量安装实践指南

在CentOS 7和8服务器上安装Rstudio-server并进行R包批量安装的步骤如下:

1.安装软件包

CentOS 7:执行相应的命令安装Rstudio-server所需的基础包。

CentOS 8:请确保您的系统已更新至最新版本,然后按照官方文档安装。

2.开放访问权限

为了通过网络访问Rstudio-server,需要在防火墙中开放8787端口。在CentOS 7和8中,分别执行:

CentOS 7: sudo firewall-cmd--permanent--add-port=8787/tcp

CentOS 8: sudo ufw allow'8787/tcp'

3.访问Rstudio-server

使用服务器的IP地址(例如192.168.1.10),在浏览器中输入:

使用提供的账号和密码登录Rstudio-server。

4.主题配置

登录后,您可以根据需要调整Rstudio-server的主题和界面设置。

5. R包管理

通过Rstudio-server,可以使用`Ctrl+ Shift+ N`快捷键新建Rscript,然后将R包列表(如800个包的列表)替换到`listOfPackages`变量中。参考生信技能树中的相关教程进行操作。

如何在 CentOS 系统上安装 Rstudio-server

在 CentOS系统上安装 Rstudio-server对于服务器管理与使用提供了极大便利,以下步骤将详细介绍如何完成这一过程。

首先,确保在管理员账号下操作,或者个人账号具有管理员权限,以便安装 R语言。在 CentOS系统中安装 R语言,可以通过两种方式进行:自动安装(使用 yum)或手动编译安装。

对于自动安装(推荐),输入以下命令:或使用管理员授权账号安装,等待安装完成。

如果遇到 CentOS版本较低导致 R的版本过低影响使用的情况,可选择手动编译安装。下载所需的 R版本,如 R4.1,使用 wget或前往官网下载。下载后解压文件,并进入 R的安装目录执行编译命令。修改环境配置文件以包含 R的安装路径。完成安装后,使用命令进行保存退出。

接下来,安装 Rstudio-server。登录 Rstudio官网,在 Products选项卡中选择 Rstudio Server,根据系统版本选择对应的版本进行下载并安装。

安装完成后,进行必要的设置。通过查看安装路径并添加文件 rserver.conf和 rsession.conf,分别配置 Rstudio-server的相关参数。确保防火墙设置允许 Rstudio-server的端口 8787通过。

如果在运行 Rstudio-server时遇到问题,检查 SELinux设置。如果 SELinux设置为 enabled,尝试将其更改为 disabled或将 Rstudio-server添加至不受 SELinux约束的列表中。重启服务器以应用更改。

最后,安装一些必要的插件,以确保后续的使用以及 R包的安装顺利。通过浏览器访问服务器 IP地址:8787即可使用 Rstudio-server。推荐使用谷歌或火狐浏览器。

此过程确保了 CentOS系统上 Rstudio-server的稳定运行与高效使用,为数据科学团队提供了强大的支持。

Rstudio Server的安装和使用(附常见问题)

在本地使用Rstudio有很多的限制,不能够长时间跑程序,而服务器上能够满足R的很多条件,通过在服务器端安装Rstudio能够和本地一样使用Rstudio。服务器的Rstudio Server通过浏览器输入IP地址完成。

注意:我这里使用的是centos 7,需要服务器的root权限。

1.1 Rstudio Server

1.2创建配置文件

1.3在防火墙配置文件中添加8787端口

1.4检查Rstudio-server是否能够运行并启动服务

1.5打开本地的浏览器,输入IP:端口号,会出现输入用户名和密码的提示。这里的用户名和密码就是每个用户自己的用户名和密码。

需要根据上面的步骤,打开rstudio的服务以及对应的网络端口。

2.1 RStudio Server安装完成后,浏览器无法打开ip:8787登录页,显示无法访问。

2.2 Rstudio server"Unable to connect to service"。在输入用户名和密码后,rstudio没有能够加载出来,并包以上出错。

2.3 Rstudio服务重启的问题。

rstudio-server有三个命令可以管理rstudio的服务

rstudio-server在重启的过程中,经常会遇到端口占用的问题,报错 Address already in use。这个错误是因为原有的进程占用已经设置好的端口,解决的方法是关闭所有占用该端口的进程。解决方案可以参考 这个网址。

2.3.1查看端口占用情况,这里我们是默认的8787端口

2.3.2结束对应的进程。这里关闭所有LISTEN相关的进程

至此,问题解决。

3参考网址

3.1

3.2

3.3

阅读剩余
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