centos openmpi(openmpi多节点运行)

大家好,centos openmpi相信很多的网友都不是很明白,包括openmpi多节点运行也是一样,不过没有关系,接下来就来为大家分享关于centos openmpi和openmpi多节点运行的一些知识点,大家可以关注收藏,免得下次来找不到哦,下面我们开始吧!

centos7上怎么用intel mpi搭建集群

您好,你的问题,我之前好像也遇到过,以下是我原来的解决思路和方法,希望能帮助到你,若有错误,还望见谅!展开全部

一.配置安装MPI

先在官网下载openmpi安装包(Linux版):下载MPI

2.然后通过一下命令安装:

解压:

tar-zxvf openmpi-1.6.4.tar.gz

进入到解压文件目录下:

cd openmpi-1.6.4

执行:(在这一步之前,要确保已经安装g++,没有安装可以输入命令:sudo apt-get install g++进行安装)

./configure

安装所有文件:(这一步会花几分钟的时间,慢慢等待)

make all install

为/etc/profile文件添加库共享路径,(默认情况下,MPI的库文件在/usr/local/lib目录下),执行sudo geidt/etc/profile,然后在其中加入一行export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/lib

执行下面命令,使配置的文件有效:

source/etc/profile

到这里MPI就已经配置完成了!

接下来测试一下:

测试成功!!!(如果出现:“cannont open shared object file…”的情况,需要重新编译source/etc/profile)

二、安装eclipse,下载eclipse。下载完毕,直接解压运行即可。

三、给eclipse装PTP插件

打开eclipse>help>install new software>>add,然后输入需要安装的PTP……

安装完成!非常感谢您的耐心观看,如有帮助请采纳,祝生活愉快!谢谢!

GCC 9 与 OpenMPI 4 编译安装

文章标题:GCC 9与 OpenMPI 4编译安装

在文献中发现HLBM模型用于模拟粒子流,该模型已在OpenLB 1.5中植入。为尝试使用,需OpenLB 1.5支持C++17及并行OpenMPI 3.1或4.1。由于课题组节点的GCC版本为4.8.5,且无法联网,且无root权限,因此选择在节点上编译安装GCC 9.5.0和OpenMPI 4.1.4。

本文在CentOS 7.9(虚拟机)与RedHat 7.5(节点)上进行了测试,均无报错。

GCC 9.5.0编译安装

首先从清华源下载GCC 9.5.0源码和依赖包,依赖包的下载建议在联网的Linux机上,先解压GCC源码包,执行./contrib/download_prerequisites自动下载依赖包。然后,将所有文件上传到节点。

将源码包和依赖包保存在/home/username/pack下,安装路径为/home/username/App,环境变量脚本放在/home/username/Script。编译GCC 9.5.0时,需要大约9GB硬盘空间(解压后1GB,编译中间文件6G,安装文件1.4GB)与1小时左右的机时(视硬件情况)。编译过程分为三步:设置configure、生成Makefile、执行Makefile进行编译、安装。

在编译时,建议使用绝对路径设置configure,并且使用--disable-multilib只编译64位的库、--enable-bootstrap追踪错误信息、--enable-checking=release以Debug方式编译。安装后,通过source~/Script/enable_gcc-9.5.0.sh设置环境变量,以避免与系统GCC4.8.5冲突。

OpenMPI 4.1.4编译安装

OpenMPI 4.1.4的安装过程与GCC相似。下载源码后,执行自动编译安装。同样需要设置环境变量,以在需要使用时快速启动。

OpenLB 1.5编译测试

从OpenLB官网下载源码,根据安装指南设置环境变量,进行编译测试。测试结果保存在tmp文件夹中,可通过paraview打开进行后处理。

【教程】CentOS 7安装WRF,SMOKE,CMAQ

本文详细介绍了在CentOS 7环境下安装WRF、SMOKE和CMAQ的全过程。SMOKE作为排放清单数据前处理模型,主要为空气质量模型提供源前处理。WRF是一个集数值天气预报、大气模拟、数据同化于一体的模型系统,广泛应用于大气环境模拟、天气研究、气象预报等领域,同时为CMAQ等空气质量模型提供气象场。CMAQ是一款第三代空气质量模型系统,主要用于环境规划、环境保护标准、环境影响评价、环境监测与预报预警等多个方面的应用。

SMOKE、WRF和CMAQ之间的关系在于:天气条件(如温度、风、云形成和降水率等)是影响大气交通的主要物理驱动力,这些条件通过WRF的输出表示。CMAQ则依赖于开源模型SMOKE来估算污染源的大小和位置,以获取所需的排放物输入数据。FEST-C系统则用于运行EPIC模型,生成CMAQ双向NH3建模所需的农业土地氮和土壤信息。

在安装WRF时,需要确保系统环境满足特定要求,如CentOS Linux、tcsh shell、依赖库(如netCDF、MPICH、Jasper、Libpng、Zlib)以及编译器(如gfortran、gcc、cpp)。安装过程中,需要通过执行一系列命令,包括安装gcc、cpp和gfortran,以及配置环境变量,以确保正确安装和使用所需工具。库的安装和兼容性测试同样重要,以确保WRF和相关组件能够协同工作。

构建WRF包括下载源代码、配置和编译过程。在完成构建后,还需要获取静态地理数据或实时数据,并通过WPS(Weather Research and Forecasting System)进行数据预处理。在实际数据案例中,需要从NCEP服务器获取GFS模型数据,并使用特定命令实时获取所需的数据文件。

CMAQ的安装同样需要满足特定的系统环境要求,包括最新的Fortran和C编译器、Git、MPI(如OpenMPI或MVAPICH2)、以及netCDF-C和netCDF-Fortran(不含netCDF4、HDF5、HDF4、DAP客户端、PnetCDF或zlib支持)。安装过程中可能遇到的一些问题,如空间不足,可以通过查找并应用相应的解决方法来克服。最终,通过配置环境变量、编译和安装CMAQ组件,以及运行测试数据,可以确保CMAQ在系统上正确运行。

本文通过详细的操作步骤和解决方法,为读者提供了在CentOS 7环境下成功安装WRF、SMOKE和CMAQ的完整指南,帮助用户在实际应用中充分利用这些工具进行大气环境模拟和空气质量研究。

阅读剩余
THE END