ubuntu 安装 pthread(ubuntu系统)
大家好,今天小编来为大家解答以下的问题,关于ubuntu 安装 pthread,ubuntu系统这个很多人还不知道,现在让我们一起来看看吧!
如何在ubuntu上装freesurfer
1.从网上下载软件压缩包
在终端中使用如下命令:
ftp surfer.nmr.mgh.harvard.edu
用户名:anonymous;密码:空,即直接回车
cd pub/dist/freesurfer/4.5.0
dir
get freesurfer-Linux-centos4-stable-pub-v4.5.0-full.tar.gz
大约需要18个小时能下载完。
2.把文件移到需要安装的目录下,并解压缩,如放到/usr/local
mv freesurfer-Linux-centos4-stable-pub-v4.5.0-full.tar.gz/usr/local
tar zxvf freesurfer-Linux-centos4-stable-pub-v4.5.0-full.tar.gz
3.安装tcsh
apt-get tcsh
4.配置环境变量
export FREESURFER_HOME=/usr/local/freesurfer
编辑~/.bashrc文件,在最后添加下面两个语句:
export FREESURFER_HOME=/usr/local/freesurfer
source$FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh
5.基本安装
在终端运行如下命令:
export FREESURFER_HOME=<freesurfer_installation_directory>/freesurfer
source$FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh
此时,终端上会打印如下信息:
Setting up environment for FreeSurfer/FS-FAST(and FSL)
FREESURFER_HOME/usr/local/freesurfer
FSFAST_HOME/usr/local/freesurfer/fsfast
FSF_OUTPUT_FORMAT nii
SUBJECTS_DIR/usr/local/freesurfer/subjects
MNI_DIR/usr/local/freesurfer/mni
6.将.license文件复制到$FREESURFER_HOME目录下
将进行注册的时候,收到的邮件中的#---------------CUT HERE---------------之间的三行复制到一个文件中,并命名为.license文件
将.license文件复制到安装目录下的freesurfer文件中
7.安装其他库文件
cd bin
ldd tksurfer.bin
此时,会在终端打印如下信息:
linux-gate.so.1=>(0xb7f5a000)
libtix8.1.8.4.so=> not found(Tix8.4 ln-s)
libtk8.4.so=> not found(TK8.4)
libtcl8.4.so=>/usr/lib/libtcl8.4.so(0xb7e95000)或者是 not found
libGLU.so.1=>/usr/lib/libGLU.so.1(0xb7e12000)
libXmu.so.6=>/usr/lib/libXmu.so.6(0xb7dfc000)
libGL.so.1=>/usr/lib/libGL.so.1(0xb7d58000)
libXext.so.6=>/usr/lib/libXext.so.6(0xb7d4a000)
libX11.so.6=>/usr/lib/libX11.so.6(0xb7c63000)
libz.so.1=>/usr/lib/libz.so.1(0xb7c4d000)
libcrypt.so.1=>/lib/tls/i686/cmov/libcrypt.so.1(0xb7c1b000)
libdl.so.2=>/lib/tls/i686/cmov/libdl.so.2(0xb7c17000)
libpthread.so.0=>/lib/tls/i686/cmov/libpthread.so.0(0xb7bff000)
libstdc++.so.6=>/usr/lib/libstdc++.so.6(0xb7b0c000)
libm.so.6=>/lib/tls/i686/cmov/libm.so.6(0xb7ae7000)
libgcc_s.so.1=>/lib/libgcc_s.so.1(0xb7adb000)
libc.so.6=>/lib/tls/i686/cmov/libc.so.6(0xb798c000)
libXt.so.6=>/usr/lib/libXt.so.6(0xb793b000)
libSM.so.6=>/usr/lib/libSM.so.6(0xb7933000)
libICE.so.6=>/usr/lib/libICE.so.6(0xb791b000)
libGLcore.so.1=>/usr/lib/libGLcore.so.1(0xb6e05000)
libnvidia-tls.so.1=>/usr/lib/tls/libnvidia-tls.so.1(0xb6e03000)
libXau.so.6=>/usr/lib/libXau.so.6(0xb6e00000)
libxcb-xlib.so.0=>/usr/lib/libxcb-xlib.so.0(0xb6dfe000)
libxcb.so.1=>/usr/lib/libxcb.so.1(0xb6de6000)
/lib/ld-linux.so.2(0xb7f5b000)
libXdmcp.so.6=>/usr/lib/libXdmcp.so.6(0xb6de0000)
这样就完成了基本的安装,但是由于是Ubuntu环境,所以在测试的时候运行qdec会提示如下错误信息:
qdec.bin: error while loading shared libraries: libtiff.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
8.解决上面出现的问题
寻找到libtiff.so.4所在路径,然后建立libtiff.o.3和libtiff.so.4之间的软连接即可。
find/-name libtiff.so.4-print
ln-s/usr/lib/libtiff.so.4/usr/lib/libtiff.so.3
9.测试软件是否安装成功
recon-all--help
会打印出一些关于软件的信息
tkmedit bert orig.mgz
tkmedit bert norm.mgz-segmentation aseg.mgz$FREESURFER_HOME/FreeSurferColorLUT.tx
tksurfer bert rh pial
qdec
逐个运行上面的命令都会打开相应软件的界面
recon-all-s bert-autorecon1
会运行大概半个小时,如果没有什么问题说明软件安装成功了。
ubuntu怎么安装chimera
1. svn checkout acpype
2. cd acpype
3. sudo ln-s$PWD/acpype.py/usr/local/bin/acpype
OVER
VMD
1. Download
2. tar zxvf vmd-*.tar.gz
3. open the configure file, change the path
"$install_bin_dir="/YOUR PATH/vmd/bin/;
$install_library_dir="/YOUR PATH/vmd/lib/$install_name"
OR using the default path in"/usr/local/lib/vmd/"
4../configure
会在底下出现一行字,大意为按照LINUXAMD64 OPENGL FLTK TK ACTC IMD SPACEBALL LIBTACHYON VRPN NETCDF TCL PYTHON PTHREADS NUMPY SILENT等参数进行configure,所以在很多的install guide中都有这么多的参数,其实在没有特殊的安装要求的情况下,可以不输入,按照default来。最重要的是红字的LINUXAMD64,即安装的系统格式,会出现为LINUX还是LINUXAMD64,全看下载的源文件是针对何种系统的。例如下图,vmd-1.9.1.bin.LINUXAMD64.opengl.tar.gz
ubuntu怎么安装Django
导读:今天首席CTO笔记来给各位分享关于ubuntu怎么安装Django的相关内容,如果能碰巧解决你现在面临的问题,别忘了关注本站,现在开始吧!
如何在ubuntu12.04下搭建PythonDjango环境
首先Ubuntu自带Python然后安装Django
这个是安装配置使用NginxUwsgi来配置Django
照着一步步来就行很简单生产环境使用
django安装各种包报错
Ubuntu新环境下搭建djangorestapi时安装MySQL-python报错。
需要安装(sudo)apt-getinstallpython-dev
python-dev是必须的?----error:Python.h
你需要自己安装一个源外的python类库,而这个类库内含需要编译的调用pythonapi的c/c++文件
你自己写的一个程序编译需要链接libpythonXX.(a|so)
(注:以上不含使用ctypes/ffi或者裸dlsym方式直接调用libpython.so)
其他正常使用python或者通过安装源内的python类库的不需
Installingcollectedpackages:MySQL-python
Runningsetup.pyinstallforMySQL-python...error
Completeoutputfromcommand/usr/bin/python-u-c"importsetuptools,tokenize;__file__='/tmp/pip-build-ZzcKHT/MySQL-python/setup.py';f=getattr(tokenize,'open',open)(__file__);code=f.read().replace('\r\n','\n');f.close();exec(compile(code,__file__,'exec'))"install--record/tmp/pip-Ur_CBU-record/install-record.txt--single-version-externally-managed--compile:
runninginstall
runningbuild
runningbuild_py
creatingbuild
creatingbuild/lib.linux-x86_64-2.7
copying_mysql_exceptions.py-build/lib.linux-x86_64-2.7
creatingbuild/lib.linux-x86_64-2.7/MySQLdb
copyingMySQLdb/__init__.py-build/lib.linux-x86_64-2.7/MySQLdb
copyingMySQLdb/converters.py-build/lib.linux-x86_64-2.7/MySQLdb
copyingMySQLdb/connections.py-build/lib.linux-x86_64-2.7/MySQLdb
copyingMySQLdb/cursors.py-build/lib.linux-x86_64-2.7/MySQLdb
copyingMySQLdb/release.py-build/lib.linux-x86_64-2.7/MySQLdb
copyingMySQLdb/times.py-build/lib.linux-x86_64-2.7/MySQLdb
creatingbuild/lib.linux-x86_64-2.7/MySQLdb/constants
copyingMySQLdb/constants/__init__.py-build/lib.linux-x86_64-2.7/MySQLdb/constants
copyingMySQLdb/constants/CR.py-build/lib.linux-x86_64-2.7/MySQLdb/constants
copyingMySQLdb/constants/FIELD_TYPE.py-build/lib.linux-x86_64-2.7/MySQLdb/constants
copyingMySQLdb/constants/ER.py-build/lib.linux-x86_64-2.7/MySQLdb/constants
copyingMySQLdb/constants/FLAG.py-build/lib.linux-x86_64-2.7/MySQLdb/constants
copyingMySQLdb/constants/REFRESH.py-build/lib.linux-x86_64-2.7/MySQLdb/constants
copyingMySQLdb/constants/CLIENT.py-build/lib.linux-x86_64-2.7/MySQLdb/constants
runningbuild_ext
building'_mysql'extension
creatingbuild/temp.linux-x86_64-2.7
x86_64-linux-gnu-gcc-pthread-DNDEBUG-g-fwrapv-O2-Wall-Wstrict-prototypes-fno-strict-aliasing-Wdate-time-D_FORTIFY_SOURCE=2-g-fstack-protector-strong-Wformat-Werror=format-security-fPIC-Dversion_info=(1,2,5,'final',1)-D__version__=1.2.5-I/usr/include/mysql-I/usr/include/python2.7-c_mysql.c-obuild/temp.linux-x86_64-2.7/_mysql.o
_mysql.c:29:20:fatalerror:Python.h:Nosuchfileordirectory
#include"Python.h"
^
compilationterminated.
error:command'x86_64-linux-gnu-gcc'failedwithexitstatus1
----------------------------------------
Command"/usr/bin/python-u-c"importsetuptools,tokenize;__file__='/tmp/pip-build-ZzcKHT/MySQL-python/setup.py';f=getattr(tokenize,'open',open)(__file__);code=f.read().replace('\r\n','\n');f.close();exec(compile(code,__file__,'exec'))"install--record/tmp/pip-Ur_CBU-record/install-record.txt--single-version-externally-managed--compile"failedwitherrorcode1in/tmp/pip-build-ZzcKHT/MySQL-python/
python2.7怎么安装django
Django提供3种发行版本,推荐使用官方的稳定版本:
1.你的操作系统提供的发行版本(Linux)
2.官方稳定版本(推荐)
3.开发测试版本
Django本质上是Python语言的一个类库,因此可以通过pip工具安装。这也是最简便最好的安装方式。不建议通过下载安装包或者编译源码进行安装的方法,除非你的环境无法连接外部网络。
首先,确保你已经安装了pip!
在Ubuntu下:sudopipinstalldjango
在windows下:命令行中pipinstalldjango
如果要指定版本,可使用pipinstalldjango=1.14.1这种形式。
摘自:刘江的博客和教程:liujiangblog-com,里面有详细的描述。
ubuntu怎么部署django
记录一次在全新服务器下配置Django项目说明:
Linux操作系统:Ubuntu16.04
Django版本:1.8.7
Python版本:2.7.12
运行模式:Ubuntu+Django+Apache2+Mod_wsgi
Apache2配置文件:sudovi/etc/apache2/apache2.conf
Apache2错误日志:cat-n/var/log/apache2/error.log
Apache2命令:
启动:sudo/etc/init.d/apache2start
重启:sudo/etc/init.d/apache2restart
停止:sudo/etc/init.d/apache2stop
配置过程如遇到错误,请仔细检查前面每一步是否有完全按照教程来执行。
1.安装Django
a)sudoapt-getinstallpython-pip
b)sudopipinstallDjango==1.10.5
2.安装Apache2
a)sudoapt-getinstallapache2
3.安装libapache2-mod-wsgi
a)sudoapt-getinstalllibapache2-mod-wsgi
4.创建项目及应用
a)创建项目
django-adminstartproject项目名称
b)创建应用(如果有应用就上传到项目目录下,否则创建)
pythonmanage.pystartapp应用名称
5.项目和应用建好后给予权限
a)chown-Rwww-data:www-data项目名称
6.配置Apache2
a)sudovi/etc/apache2/apache2.conf
169-177行是我添加的内容
169Directory/home/z/product/Code(改为自己的项目目录)
170OptionsIndexesFollowSymLinks
171AllowOverrideNone
172Requireallgranted
173/Directory
174WSGIScriptAlias//home/z/product/Code/Code/wsgi.py(改为自己的项目文件)
175WSGIPythonPath/home/z/product/Code(改为自己的项目文件)
176Alias/static//home/z/product/Code/business/static/(改为自己的项目内的应用)
177Alias/static//home/z/product/Code/yyl/static/(改为自己的项目内的应用)
169-175行的功能为添加项目至Apache
176和177行是为了加载应用内/static/目录内的静态资源
错误及解决方案:
下面错误可能只是自己当前项目中所遇到的错误,其他项目请忽略。
问题一:ImportError:Nomodulenamedcelery
sudopipinstallgit+
问题二:NomodulenamedPIL.ImImagePlugin
sudoapt-getinstallpython-imaging
问题三:Nomodulenamedrequests
sudopipinstallrequests
问题四:Nomodulenameddss.Serializer
sudopipinstalldjango-simple-serializer
Ubuntu14.04下Django+MySQL安装部署全过程
Ubuntu16.04下安装部署Nginx+uWSGI+Django1.9.7
Django的详细介绍:请点这里
Django的下载地址:请点这里
本文永久更新链接地址:
腾讯云python系列之部署Django流程
我的是centos系统
我们通过腾讯的控制台的登录按钮,进入到远程登录的界面,如图1为腾讯云的控制台界面。图2为登录以后的密码输入窗口
进入登录界面以后,会是图3这样子的情况,我们输入ls,会发现没有任何文件,输入piplist会提示没有安装pip,而输入python时,会显示默认安装了python2.7.5版本
一、首先我们要安装pip,根据自己的系统自行选择
centos类系统:sudoyuminstallpythonpython-pip
ubuntu类系统:sudoapt-getinstallpythonpython-pip
安装好以后piplist一下,看看都有哪些python安装包
二、安装django
我安装的Django版本为1.9.8的,根据自己的情况,更改后面的版本号
sudopipinstallDjango==1.9.8
可能会出现图4这样的问题,原因是我们pip版本太低,直接按照提示升级我们的pip
更新了pip以后,安装可能会出现如图5这样的问题,我们不要在==两边加空格,因为加空格会导致不识别django的版本。
安装完以后你会发现自己找不到Django放在哪里了,其实我的django被安装在了
/usr/lib/python2.7/site-packages/
并且我们要执行创建django的命令在django的bin目录下,如图6
/usr/lib/python2.7/site-packages/django/bin
进入到该目录下,运行django-admin.pystartprojectFirstProject,创建出FirstProject的项目。就会在该目录下创建出FirstProject这个项目,进入项目,运行pythonmanage.pyrunserver
问题来了,我们运行以后,不要点击,这个是进不去的,我们应该通过腾讯云的公网ip来访问网站,但又有同学发现通过公网的ip也无法访问我们的网站,这是因为自己的腾讯云没有打开相应的端口,所以无法访问。开放端口在安全组这个选项,如图7
进入安全组,新建我们的开放端口,我开放的是80端口。如图8
开放端口后,我们重新pythonmanage.pyrunserver0.0.0.0:80,如图9
通过公网ip,就可以直接访问我们的网站了。如图10
如何在ubuntu下配置Django和apache+mod
参考一下:
Apache是全球使用率最高的、开源的一个Web服务端软件,现在介绍一下如何在Ubuntu14.04上安装和配置Apache。
工具/原料
Ubuntu14.04
方法/步骤
命令行安装Apache
打开"终端窗口",输入"sudoapt-getinstallapache2"--回车--输入"root用户的密码"--回车--输入"y"--回车,安装完成
默认的网站根目录的路径
Apache安装完成后,默认的网站根目录是"/var/www/html",在终端窗口中输入"ls/var/www/html"--回车--在网站根目录下有一个"index.html"文件,在ie浏览器中输入"127.0.0.1"--回车,就可以打开该页面。
Apache的第一个配置文件apache2.conf的路径
在终端窗口中输入"ls/etc/apache2"--回车--有一个"apache2.conf"的配置文件。
Apache的第二个配置文件000-default.conf的路径
在终端窗口中输入"ls/etc/apache2/sites-available"--回车--有一个"000-default.conf"的配置文件。
修改网站的根目录
1、在终端窗口中输入"sudovi/etc/apache2/apache2.conf"--回车--找到"Directory/var/www/"的位置--更改"/var/www/"为新的根目录就可以了。
2、在终端窗口中输入"sudovi/etc/apache2/sites-available/000-default.conf"--回车--找到"DocumentRoot/var/www/html"的位置--更改"/var/www/html"为新的根目录就可以了,这里我把它更改为"/var/www/"。
重启Apache
在终端窗口中输入"sudo/etc/init.d/apache2restart"--回车--"输入root用户密码"--回车--重启成功。
复制"index.html"文件到"/var/www"目录下
在终端窗口中输入"cp/var/www/html/index.html/var/www/"--回车--输入"ls/var/www"--回车--有一个"index.html"文件,复制成功。
测试更改网站根目录是否成功
在"火狐浏览器"中输入"127.0.0.1"--能访问到"index.html"文件--更改成功
结语:以上就是首席CTO笔记为大家介绍的关于ubuntu怎么安装Django的全部内容了,希望对大家有所帮助,如果你还想了解更多这方面的信息,记得收藏关注本站。