ubuntu mpi？Ubuntu软件中心
老铁们，大家好，相信还有很多朋友对于ubuntu mpi和Ubuntu软件中心的相关问题不太懂，没关系，今天就由我来为大家分享分享ubuntu mpi以及Ubuntu软件中心的问题，文章篇幅可能偏长，希望可以帮助到大家，下面一起来看看吧！
在Ubuntu上安装消息传递接口Open MPI库的教程
OpenMPI是一种高性能消息传递库，最初是作为融合的技术和资源从其他几个项目（FT- MPI, LA-MPI, LAM/MPI,以及 PACX-MPI），它是MPI-2标准的一个开源实现，由一些科研机构和企业一起开发和维护。因此，OpenMPI能够从高性能社区中获得专业技术、工业技术和资源支持，来创建最好的MPI库。OpenMPI提供给系统和软件供应商、程序开发者和研究人员很多便利。易于使用，并运行本身在各种各样的操作系统，网络互连，以及一批/调度系统。
Open MPI并不是LAM/MPI, LA-MPI和FT-MPI的简单组合，而是一种全新的MPI实现，其完全实现了MPI-1.2和MPI-2规约，并且完全支持并发和多线程应用（也就是MPI_THREAD_MULTIPLE）。
为了有效有效支持大范围的并行机，开发了高性能驱动程序，其中包括TCP/IP, shared memory, Myrinet, Quadrics, and Infiniband，更多的机器支持可能会基于用户、市场和研究需要而增加。对于网络传输错误，Open MPI提供了一种可选的特性来检测数据的完整性。通过使用报文分段和拆分到多个网络设计，Open MPI不仅可以达到可用带宽的最大值，而且当节点使用多台网络设备的时候，可以动态处理网络设备的数据丢失。
Open MPI的运行时环境提供了启动和管理并行应用的基本服务。
Ubuntu安装 OpenMPI
1.下载OpenMPI
在官网（）上下载最新版本的安装包，如：openmpi-1.8.4.tar.gz
2.解压并进行配置
代码如下:
tar-zxvf openmpi-1.8.4.tar.gz
cd openmpi-1.8.4
./configure--prefix="/usr/local/openmpi"
注意最后一行是将其安装到/usr/local/openmpi目录下，可以指定为其他目录，如，用户目录下。
3. Build并安装
代码如下:
make
sudo make install
可以在make后加参数-j8,表示用8核编译
4.添加环境变量
在.bashrc文件中添加下列几行
代码如下:
export PATH="$PATH:/usr/local/openmpi/bin"
export LD_LIBRARY_PATH="$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/openmpi/lib/"
保存后，执行
代码如下:
sudo ldconfig
打开新的终端，使环境变量生效。
5.测试是否安装成功
代码如下:
mpirun
其他
Open MPI使用简单C语言面向对象系统实现，使用基于单一继承和引用计数的retain/release内存管理模型。一个object由一个结构体和单一实例化的class标识符组成。结构体的首个元素一个是指定父类结构体的指针。
宏指令会对C++类似的语义（如new, construct, destruct, delete）产生影响。因为C++项目的丰富经验和某些平台编译方面的问题，使得在开发Open MPI使用了面向对象方法，而不是直接使用C++。
一旦构造，对象引用计数被设置为1。当对象retain，计数递增，当对象release，计数递减。当计数到达0，会运行对象的析构器并释放内存。
Ubuntu21.04+CMake+Modules切换运行OpenMPI库和MPICH库
在处理并行库在单一系统中的切换使用问题时，可以利用环境变量管理工具如Modules来实现。以下步骤展示了如何在Ubuntu 21.04系统中安装并调用不同版本的OpenMPI库和MPICH库。
首先，确保已安装了必要的编译工具和环境。接着，进行如下操作：
1.安装OpenMPI 4.1.1版本。
2.安装MPICH 4.0.a2版本。
安装完毕后，可通过执行`module avail`命令查看所有可加载的模块。
为了加载并使用OpenMPI 4.1.1，执行`module load eric/openmpi-4.1.1`。此命令会显示"loaded"，表示模块已成功加载。随后，执行`cmake../`和`cmake--build.--parallel 4`以编译并行程序。使用`mpirun-np 2./mpi_prj`来运行使用OpenMPI的MPI程序。
接下来，为了测试MPICH，先清理当前环境，执行`module load eric/mpich-4.0.a2`以加载MPICH。然后，重复上述编译和运行步骤，实现使用MPICH的MPI程序。
通过上述步骤，可以在同一环境下实现对不同并行库的调用与管理。为了方便未来查询，将此类内容整理并记录。
ubuntu benchmark怎么进行测试
一、Linpack简介
Linpack是国际上最流行的用于测试高性能计算机系统浮点性能的benchmark。通过对高性能计算机采用高斯消元法求解一元N次稠密线性代数方程组的测试，评价高性能计算机的浮点性能。
Performance Linpack，也叫高度并行计算基准测试，它对数组大小N没有限制，求解问题的规模可以改变，除基本算法（计算量）不可改变外，可以采用其它任何优化方法。前两种测试运行规模较小，已不是很适合现代计算机的发展。
HPL是针对现代并行计算机提出的测试方式。用户在不修改任意测试程序的基础上，可以调节问题规模大小(矩阵大小)、使用CPU数目、使用各种优化方法等等来执行该测试程序，以获取最佳的性能。HPL采用高斯消元法求解线性方程组。求解问题规模为N时，浮点运算次数为(2/3* N^3－2*N^2)。因此，只要给出问题规模N，测得系统计算时间T，峰值=计算量(2/3* N^3－2*N^2)/计算时间T，测试结果以浮点运算每秒（Flops）给出。HPL测试结果是TOP500排名的重要依据。
二、Linpack安装与测试
1． Linpack安装条件：
在安装HPL之前，系统中必须已经安装了编译器、并行环境MPI以及基本线性代数子方程(BLAS)或矢量图形信号处理库(VSIPL)两者之一。
在Ubuntu下，使用apt-get安装gfortran，mpich2，每个计算节点都需要安装
安装完后，可先使用mpicc编译helloworld验证mpi集群是否工作正常
hpl linpack缺省配置是使用atlas的库，所以这里我们安装ATLAS
参考
根据atlas的安装文档,首先要switch off cpu throttling.首先安装cpufrequtils和cpufreqd这两个包,也许还要安装powernowd包
从下载atlas
cd ATLAS
mkdir build
cd build
../configure
make
编译没有问题的话会在lib目录下生成几个静态库
2．安装与编译Linpack：
第一步，从www.netlib.org/benchmark/hpl网站上下载HPL包hpl.tar.gz并解包
cd hpl-2.1
cp setup/Make.Linux_PII_CBLAS_gm Make.x86_64
vi Make.x86_64
修改下列配置：
ARCH= x86_64
TOPdir=$(HOME)/projects/hpl-2.1
LAdir=$(HOME)/projects/ATLAS/build/lib
LAinc=
LAlib=$(LAdir)/libcblas.a$(LAdir)/libatlas.a
然后开始编译：
make arch=x86_64
如果出现符号找不到的问题，请检查LAlib的库的位置
cd bin/x86_64
在这个目录下生成了两个文件， HPL.dat是linpack计算的配置文件， xhpl是测试程序
这里有关于HPL.dat的配置说明：
其中几个重要的参数(必须针对集群环境修改）
1#表示只做一次计算，使用下面的第一个数
100000 30 34 35 Ns#矩阵大小，为了测试性能，一般取N*N*8~内存总量，集群时考虑总内存量
1# of NBs
192 2 3 4 NBs#分块大小，经验值192
4 1 4 Ps# PxQ应该等于整个集群的进程数，一般等于cpu核数
16 4 1 Qs# P一般<=Q
如果是单机，可以运行mpiexec-n 64./xhpl来看一下是否工作正常。
对于集群，首先需要保证所有机器的可以相互使用ssh无密码登录（比如要从s1登录到s2,需要把s1上的.ssh/id_rsa.pub内容拷贝到s2的.ssh/authorized_keys里。
然后创建mpi_hosts文件，内容就是集群内各机器名称，每个机器一行。
在每个机器上，都需要有相同的用户，以及同样的hpl-2.1路径和文件HPL.data，xhpl程序
运行mpiexec-n 64-f mpi_hosts,./xhpl
注意：
1.矩阵不能太小，要保证矩阵数据可以占用大量内存，运行时可以free来查看内存使用量，用top，然后按1来查看cpu每个核的使用情况
2.节点间数据传输量比较大，应该使用万兆网络，否则网络会成为瓶颈。
3.本文只是为了验证，并不是为了优化benchmark。如果要达到更好的benchmark数值，应该使用优化的blas库，比如intel的mkl。intel的mkl本身就带了linpack测试程序
