ubuntu blas ubuntu哪个版本最好

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linux关于blas、lapack的安装和使用

Linux系统下,若需进行高效且便捷的BLAS和LAPACK库安装与使用,推荐选用Intel的MKL库。本文将对MKL库的使用进行实例展示,并概述BLAS、LAPACK、CBLAS与LAPACKE库的安装与配置。

BLAS(Basic Linear Algebra Subprograms)提供基础矩阵与向量运算,而LAPACK(Linear Algebra Package)则具备更丰富的线性方程求解、二次规划、特征值分解等高级运算功能。为了在C语言中调用这些库,同时考虑在Python中调用C生成的动态库(.so文件),需要一并安装CBLAS与LAPACKE。

在Ubuntu与CentOS等Linux发行版上安装与配置BLAS、CBLAS、LAPACK与LAPACKE库,通常能实现顺利的编译与使用。确保库文件与头文件的正确路径,例如将其放置在/usr/local/lib与/usr/local/include目录下,或通过用户级别的~/.bashrc文件添加路径配置。

在进行库的链接与编译时,需注意库的链接顺序,这可能影响程序的正常运行。若遇到头文件或静态库未找到的问题,可参考上述路径配置或在编译时通过`-I`与`-L`参数指定路径。

对于Python调用C生成的动态库的需求,需对LAPACK的编译选项进行调整。通过修改~/lapack-3.10.1/make.inc文件,将相关设置增加`-fPIC`选项,进而重新编译生成BLASlib、CBLASlib、LAPACKlib与LAPACKelib。这一步骤能确保动态库的生成兼容Python环境。

如遇编译过程中出现错误,如“/usr/bin/ld: cannot find xxxx”的提示,这通常意味着库文件路径未正确添加。通过搜索与执行“编译-L”相关指令,可解决找不到库文件的问题。

总结而言,Linux环境下,通过正确安装与配置BLAS、CBLAS、LAPACK与LAPACKE库,结合Intel MKL库的使用实例,能高效地满足各类矩阵与线性代数运算需求。同时,本文提供的安装与使用指导,旨在简化这一过程,确保用户能快速上手并高效地在多种编程环境中应用这些关键库。

ubuntu benchmark怎么进行测试

一、Linpack简介

Linpack是国际上最流行的用于测试高性能计算机系统浮点性能的benchmark。通过对高性能计算机采用高斯消元法求解一元N次稠密线性代数方程组的测试,评价高性能计算机的浮点性能。

Performance Linpack,也叫高度并行计算基准测试,它对数组大小N没有限制,求解问题的规模可以改变,除基本算法(计算量)不可改变外,可以采用其它任何优化方法。前两种测试运行规模较小,已不是很适合现代计算机的发展。

HPL是针对现代并行计算机提出的测试方式。用户在不修改任意测试程序的基础上,可以调节问题规模大小(矩阵大小)、使用CPU数目、使用各种优化方法等等来执行该测试程序,以获取最佳的性能。HPL采用高斯消元法求解线性方程组。求解问题规模为N时,浮点运算次数为(2/3* N^3-2*N^2)。因此,只要给出问题规模N,测得系统计算时间T,峰值=计算量(2/3* N^3-2*N^2)/计算时间T,测试结果以浮点运算每秒(Flops)给出。HPL测试结果是TOP500排名的重要依据。

二、Linpack安装与测试

1. Linpack安装条件:

在安装HPL之前,系统中必须已经安装了编译器、并行环境MPI以及基本线性代数子方程(BLAS)或矢量图形信号处理库(VSIPL)两者之一。

在Ubuntu下,使用apt-get安装gfortran,mpich2,每个计算节点都需要安装

安装完后,可先使用mpicc编译helloworld验证mpi集群是否工作正常

hpl linpack缺省配置是使用atlas的库,所以这里我们安装ATLAS

参考

根据atlas的安装文档,首先要switch off cpu throttling.首先安装cpufrequtils和cpufreqd这两个包,也许还要安装powernowd包

从下载atlas

cd ATLAS

mkdir build

cd build

../configure

make

编译没有问题的话会在lib目录下生成几个静态库

2.安装与编译Linpack:

第一步,从www.netlib.org/benchmark/hpl网站上下载HPL包hpl.tar.gz并解包

cd hpl-2.1

cp setup/Make.Linux_PII_CBLAS_gm Make.x86_64

vi Make.x86_64

修改下列配置:

ARCH= x86_64

TOPdir=$(HOME)/projects/hpl-2.1

LAdir=$(HOME)/projects/ATLAS/build/lib

LAinc=

LAlib=$(LAdir)/libcblas.a$(LAdir)/libatlas.a

然后开始编译:

make arch=x86_64

如果出现符号找不到的问题,请检查LAlib的库的位置

cd bin/x86_64

在这个目录下生成了两个文件, HPL.dat是linpack计算的配置文件, xhpl是测试程序

这里有关于HPL.dat的配置说明:

其中几个重要的参数(必须针对集群环境修改)

1#表示只做一次计算,使用下面的第一个数

100000 30 34 35 Ns#矩阵大小,为了测试性能,一般取N*N*8~内存总量,集群时考虑总内存量

1# of NBs

192 2 3 4 NBs#分块大小,经验值192

4 1 4 Ps# PxQ应该等于整个集群的进程数,一般等于cpu核数

16 4 1 Qs# P一般<=Q

如果是单机,可以运行mpiexec-n 64./xhpl来看一下是否工作正常。

对于集群,首先需要保证所有机器的可以相互使用ssh无密码登录(比如要从s1登录到s2,需要把s1上的.ssh/id_rsa.pub内容拷贝到s2的.ssh/authorized_keys里。

然后创建mpi_hosts文件,内容就是集群内各机器名称,每个机器一行。

在每个机器上,都需要有相同的用户,以及同样的hpl-2.1路径和文件HPL.data,xhpl程序

运行mpiexec-n 64-f mpi_hosts,./xhpl

注意:

1.矩阵不能太小,要保证矩阵数据可以占用大量内存,运行时可以free来查看内存使用量,用top,然后按1来查看cpu每个核的使用情况

2.节点间数据传输量比较大,应该使用万兆网络,否则网络会成为瓶颈。

3.本文只是为了验证,并不是为了优化benchmark。如果要达到更好的benchmark数值,应该使用优化的blas库,比如intel的mkl。intel的mkl本身就带了linpack测试程序

深入浅出在Linux中安装BLASlinux安装blas

Linux是一种廉价且丰富的操作系统,它使用者可以选择安装支持各种应用程序的依赖库,BLAS(Basic Linear Algebra Subprograms)就是其中之一。BLAS是一个用于矩阵操作的API(Application Programming Interface),提供了基本的线性代数及数值分析的扩展功能,用于机器学习及其他数值分析领域十分流行。本文将介绍如何在Linux系统中安装BLAS库。

要在Linux上安装BLAS,你需要安装GNU的GCC编译器。使用以下命令以在Ubuntu/Debian系统上安装GCC:

`sudo apt-get install gcc`

接着,我们需要从BLAS官网下载最新的安装包:

`wget `

将其解压,在linux终端输入如下命令:

`tar xvf blas.tgz`

进入解压后的文件夹,我们需要编译BLAS:

`cd blas/`

`gcc-O2-c*.c`

`gcc-O2-shared-o libblas.so*.o`

完成编译后,我们需要设置环境变量:

`export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$PWD`

最后,我们要将已经编译后的文件安装到Linux中:

`sudo cp libblas.so/usr/lib/libblas.so`

现在,BLAS库已经安装完毕,我们可以调用相关API来操作进行矩阵操作等操作。

总之,安装BLAS库在Linux系统中非常简单。只需要几步操作,就可以安装BLAS库,然后就可以调用相关接口来进行矩阵操作等操作。

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