Centos intelmpi Ubuntu centos

大家好,今天小编来为大家解答Centos intelmpi这个问题,Ubuntu centos很多人还不知道,现在让我们一起来看看吧!

Centos Stream 9 & VASP 6.1.2安装 & CP2K 2022.2安装

在CentOS Stream 9系统上安装VASP 6.1.2和CP2K 2022.2涉及到一系列的软件和环境配置。首先,确保显卡驱动和Intel oneAPI正确安装。安装NVIDIA-CUDA驱动时,需要检查是否已正确安装,并通过命令`lsmod| grep nouveau`和`nvidia-smi`确认驱动状态。如果驱动安装后未显示,可以参考相关教程解决。

安装Intel oneAPI Base Toolkit包括wget并下载安装脚本,通过脚本完成安装。在配置环境变量时,需要使用`vim~/.bashrc`命令编辑.bashrc文件,添加`source/opt/intel/oneapi/setvars.sh intel64`,并确保通过`source~/.bashrc`使环境变量生效。

安装GCC系列以及软件开发辅助工具,使用`sudo yum install`命令分别安装C编译器、C++编译器和Fortran编译器,以及兼容库。此外,还需安装make、gdb、cmake和git等工具以支持软件开发。

接下来,对fftw3xf文件进行权限设置和编译。确保文件及其子目录可读、可写、可执行,并使用make命令生成库文件。然后,进行VASP 6.1.2的编译配置,下载并解压VTST-Tools,将所需文件复制到src目录中,修改src/main.F源码以适应特定需求,并下载solvation.F文件,更新src/mpi.F文件,调整配置以适应不同CPU类型。

完成编译配置后,使用`make`命令编译三个版本的VASP:Gamma only版、非共线版和标准版。通过在终端中运行不同版本的vasp命令,验证VASP的正确安装和运行。

为了测试VASP,下载并解压测试任务包,执行mpirun命令调用VASP进行测试。如果遇到运行异常,可以尝试在~/.bashrc中添加`ulimit-s unlimited`命令,以避免操作系统对堆栈内存尺寸的限制。

最后,安装CP2K 2022.2,通过编辑环境变量并执行特定脚本来安装和配置CP2K。确保执行前已正确设置CP2K的环境,并使用mpirun命令执行CP2K,通过检查输出文件验证安装是否成功。

以上步骤详细介绍了在CentOS Stream 9系统上安装VASP 6.1.2和CP2K 2022.2的完整流程,包括软件安装、环境配置和验证步骤,确保了软件的正确部署和运行。

centos7上怎么用intel mpi搭建集群

您好,你的问题,我之前好像也遇到过,以下是我原来的解决思路和方法,希望能帮助到你,若有错误,还望见谅!展开全部

一.配置安装MPI

先在官网下载openmpi安装包(Linux版):下载MPI

2.然后通过一下命令安装:

解压:

tar-zxvf openmpi-1.6.4.tar.gz

进入到解压文件目录下:

cd openmpi-1.6.4

执行:(在这一步之前,要确保已经安装g++,没有安装可以输入命令:sudo apt-get install g++进行安装)

./configure

安装所有文件:(这一步会花几分钟的时间,慢慢等待)

make all install

为/etc/profile文件添加库共享路径,(默认情况下,MPI的库文件在/usr/local/lib目录下),执行sudo geidt/etc/profile,然后在其中加入一行export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/lib

执行下面命令,使配置的文件有效:

source/etc/profile

到这里MPI就已经配置完成了!

接下来测试一下:

测试成功!!!(如果出现:“cannont open shared object file…”的情况,需要重新编译source/etc/profile)

二、安装eclipse,下载eclipse。下载完毕,直接解压运行即可。

三、给eclipse装PTP插件

打开eclipse>help>install new software>>add,然后输入需要安装的PTP……

安装完成!非常感谢您的耐心观看,如有帮助请采纳,祝生活愉快!谢谢!

使用Intel oneAPI编译器安装WRF和WPS

在2024年1月下旬,本文详述了在CentOS系统下,使用Intel oneAPI编译器安装WRF和WPS的步骤。以下是详细的安装过程:

安装WRF

首先,从github.com/wrf-model/WR...获取WRF-V4.5.2.tar.gz版本。

运行configure文件时,选择oneAPI版本78或79。对于mpi支持,即使没有明确提示,也需要修改MD_FC和DM_CC,将它们设为mpiifx和mpiicx。若选择78,取消对OMP的注释。

保存更改后,使用-j 4(4核并行编译)开始编译,注意输出保存到log文件以供后续调试。

安装过程中,通过命令查看进度。

安装WPS

下载WPS-V4.5.tar.gz,同样从github获取。

配置时,选择19. Linux x86_64, Intel compiler(dmpar)。

在cio.c文件中,为所有函数添加int返回类型,以符合新版编译器要求。

在configure.wps中,更新icc和ifort命令,并在WRF_LIB部分添加必要的lib参数(如-liomp5和-lpthread)。

若使用最新版Jasper,可能需要修改Jasper的lib路径,将其指向lib64。

对于dec_jpeg2000.c的修改,如果遇到引用错误,将相关代码行替换以解决编译问题。

最终,通过修改后的./compile命令确认安装成功,如果geogrid.exe、metgrid.exe和ungrib.exe都编译成功,即安装完成。

以上是基于当时最新版本软件和配置的指导,具体情况可能会因软件更新而有所变化。在实际操作时,务必根据最新文档和版本进行调整。

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