sclo centos，centos docker

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Centos6.10解决yum源失效

在项目开发过程中，常常需要使用 CentOS 6.10和 devtoolset-6。然而， CentOS 6.10已于2020年11月30日停止维护，导致原有 CentOS系统自带的 Yum无法连接到旧版本的仓库，出现 YumRepo Error。此问题需要通过更新陈旧版本的仓库，使之指向可用的 vault来解决。

为了解决 Yum安装出现的错误，首先需要对 yum源进行修改。步骤如下：

1.备份系统旧源

2.编辑 CentOS-Base.repo

在该文件中，需要将所有配置项 mirrolist开头的源地址注释掉，然后拷贝所有配置项 baseurl开头的源地址行，并去除#号注释，同时将源地址修改为官方镜像源地址。文中以 centos6.10为例，将 baseurl中的$releaserver替换成 6.10。

修改后的 CentOS-Base.repo配置如下：

执行以下命令重建镜像源缓存，测试配置的镜像源是否生效：

yum主要常用命令如下：

完成上述操作后，接下来需要进行以下步骤以安装使用 SCL+devtoolset-6。

1.安装 SCL，安装完成后，会在/etc/yum.repos.d下生成 2个 repo源文件。

2.配置 SCL源。

在 CentOS-SCLo-scl.repo和 CentOS-SCLo-scl-rh.repo文件中，分别备份文件后，需要将 centos-sclo-sclo和 centos-sclo-rh项下的 mirrorlist注释掉，拷贝 baseurl行，去除#注释，并修改源地址为新的镜像源地址。

修改后的 CentOS-SCLo-scl.repo和 CentOS-SCLo-scl-rh.repo配置如下：

由于项目需求安装 devtoolset-6，因此需要将源地址中"centos/6"修改为"centos/6.9"，以便指向 devtoolset-6安装包所在的 6.9目录，确保路径与 devtoolset版本需求相匹配。

5.清理重建 yum缓存

3.安装 scl工具

4.安装 devtoolset-6

通过以上步骤，可有效解决 CentOS6.10配置 yum源失效的问题，同时成功安装使用 SCL+devtoolset-6，满足项目开发需求。

服务器安装新版本R及Seurat方法

Seurat需要很多新的依赖包，否则会安装失败。服务器为CentOS版本。

目前报错的，未完成安装的依赖包有：httr,leiden,plotly,reticulate,SeuratObject.

目前已更新的依赖包包括：

openssl：sudo yum install openssl openssl-devel。更新后可以完成安装httr包。

gcc+版本（本步骤目的为安装RcppTOML）：

首先安装：sudo yum install centos-release-scl scl-utils-build-y

之后运行：sudo yum list all--enablerepo='centos-sclo-rh'| grep"devtoolset-"，查看可用的版本。查看到最新版本为9

之后运行：sudo yum install devtoolset-9-toolchain-y，完成安装

启动：sudo scl enable devtoolset-9 bash（永久启动：echo"source/opt/rh/devtoolset-8/enable">>/etc/profile，但是没有权限）

这样之后，在启动了devtoolset9的情况下，RcppTOML终于装上了！

geos(for rgeos)安装：sudo yum install geos geos-devel

这些都搞完后，最后成功安装了Seurat。

CentOS7 安装GCC 11

在 CentOS7中安装 GCC 11，首先需了解默认版本为4.8.5，执行相关命令会报错。为解决此问题，应先卸载旧版本。

操作步骤如下：

1.使用命令：sudo yum remove gcc及 sudo yum remove gdb卸载默认版本。

2.验证卸载情况，执行命令：gcc-v g++-v gdb，若无输出，则卸载成功。

3.安装 scl-utils和 centos-release-scl：

sudo yum install scl-utils

sudo yum install centos-release-scl

4.列出所有启用 centos-sclo-rh的包，查找与开发工具链相关的内容。

5.直接下载并安装开发工具链：sudo yum install-y devtoolset-11-toolchain

6.启用 devtoolset-11版本的工具链：sudo scl enable devtoolset-11 bash

7.查看安装的 GCC版本信息：gcc–v

至此，CentOS7中已成功安装并启用 GCC 11，提供了更高的开发效率。此教程仅为参考，具体操作请结合实际环境进行调整。