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生信学习笔记(二):Windows11安装Linux子系统—WSL2的部署

WSL（Windows Subsystem for Linux）是微软为Windows操作系统设计的一个功能，允许用户在Windows上运行Linux系统，相当于一个高度整合的虚拟机，但无需使用VMware等虚拟软件。相比于WSL1，WSL2具备完整的Linux内核和更好的使用体验，适用于计算量需求不大的场景或个人Linux系统学习。本文将详细介绍如何在Windows 11系统上部署WSL2，并安装及使用Miniconda3。

部署步骤如下：

系统要求：确保Windows 11系统已安装。

系统版本查看：通过命令行工具查看当前Windows系统版本。

启用适用于Linux的Windows子系统：使用管理员权限运行命令行工具，执行启用WSL2的命令。

更新WSL2的Linux内核更新包：下载适用于x64计算机的WSL2内核更新包并安装。

设置WSL2为默认版本：使用管理员权限运行命令行工具，设置WSL2为默认的WSL版本。

安装Linux子系统：通过Microsoft Store搜索Linux，选择合适的发行版本并安装，本文以Ubuntu 18.04.5 LTS为例。

创建账户并设置密码：安装完成后，打开Ubuntu，系统会自动完成初始化并要求创建账户及设置密码。

文件传递：通过Win+E打开此电脑，左侧找到Linux并打开对应版本的Linux目录，进入系统根目录进行文件传递。

SSH连接WSL2：使用MobaXterm或其他SSH软件连接WSL2，输入命令获取IP地址，进行SSH登录。

在Windows系统和WSL2之间实现文件传递，使用命令行工具如`cp`或`mv`命令。

允许Windows以root账户登录：进行特定设置以实现此功能。

WSL迁移与扩容：通过git下载和安装，使用特定命令迁移和扩容WSL系统。

参考资料：相关技术文章链接。

生信分析怎么学

学习生信分析需要具备一定的计算机、生物学和统计学知识，建议按以下步骤学习：

1.建立基础知识：先学习生物学、计算机科学和统计学的基础知识，掌握常用的生物学术语和基本的编程概念。可以参考一些经典教材如《生物信息学导论》、《R语言实战》等。

2.学习常用工具和软件：学习生物信息学分析中常用的工具和软件，例如NCBI、BLAST、UCSC等数据库和软件，学习Linux操作系统和常用命令，掌握编程语言如Perl、Python、R等的使用。

3.参加课程或培训：参加一些线上或线下的课程或培训，例如Coursera上的生物信息学课程、培训班、讲座等，了解生物信息学分析的流程和方法，掌握实践技能。

4.实践和练习：通过实际项目的实践，积累经验和技能。可以通过参加竞赛、学术项目或者开源社区的项目来进行实践。

5.学习交流：通过参加学术会议、讨论组、社区等渠道，与其他从业人员交流和分享经验，了解最新的技术发展和应用实践。

总之，星科SCIER认为学习生信分析需要综合多个学科知识，需要不断实践和练习，才能熟练掌握相关技能。

生信技能28-Linux服务器安装R包方式汇总

在Linux服务器上安装R包，有多种方法可供选择，每种方法各有优劣，适合不同的用户需求。下面列出四种主要的安装方式。

首先，对于部分R包容易安装失败的情况，推荐使用conda安装。用户只需进入anaconda.org网址，搜索R包如repitools和LDlinkR等，通过conda工具一键安装，省时省力。

其次，在线安装源文件包也是推荐的方法之一。以安装LDlinkR包为例，用户需先访问cran.r-project.org/web/...网址，获取软件包LDlinkR_1.3.0.tar.gz链接。接下来，在R环境中输入命令，即可完成包的安装。

另外，用户还可以选择本地安装源文件包。同样以LDlinkR包为例，下载软件包至本地后，在R中通过命令进行安装，这种方式适用于不希望从网络下载的用户。

最后，命令行安装是另一种直接快捷的方法。以安装shiny包为例，Linux版本的用户可在命令行中输入指令，自动从网络下载并安装所需的包。

每种安装方式都有其适用场景，用户可根据实际需求和偏好选择最合适的方法，高效、便捷地在Linux服务器上安装R包。