centos 7 boost?centos更新软件命令
本篇文章给大家谈谈centos 7 boost,以及centos更新软件命令对应的知识点,文章可能有点长,但是希望大家可以阅读完,增长自己的知识,最重要的是希望对各位有所帮助,可以解决了您的问题,不要忘了收藏本站喔。
CentOS 7下编译安装Open Babel2.4.1和python绑定
Open Babel是一款开源自由软件,能够进行化学结构文件格式的相互转换,通过C++编写并提供C++、Perl、Python等多种API接口,方便开发使用。
为了在CentOS 7下编译安装Open Babel 2.4.1并绑定Python,首先需下载Open Babel 2.4.1的安装包,通过下载地址进行下载。
其次,安装boost库,这是Open Babel运行所需的依赖库之一。
继续安装gcc、g++、make、cmake,这四个工具将用于后续的编译和构建过程。
安装依赖的开发库,Eigen库也是必需的,下载Eigen2和Eigen3版本,并解压至/usr/local/include目录。
为了支持Python(Python2.7)绑定,需安装Python开发库。
完成所有准备工作后,进行编译安装步骤,确保所有命令执行成功。
设置环境变量,以便在系统中正确访问Open Babel的库和工具。
最后一步,检查Open Babel 2.4.1和Python绑定是否成功安装。通过执行相关命令或脚本来验证安装是否成功,确保一切功能正常运行。
综上所述,通过遵循上述步骤,用户能够在CentOS 7系统中成功编译安装Open Babel 2.4.1并实现与Python的绑定,从而高效地处理化学结构文件的转换任务。
CentOS7配置Rosetta安装教程
Rosetta是一个在计算结构生物学领域具有重要地位的软件工具,它包含了一系列用于蛋白质结构建模和分析的算法与评分函数,适用于蛋白质设计、酶设计、分子对接及生物大分子复合物的结构预测等任务。要使用Rosetta,首先需要下载其源代码。
Rosetta提供两种版本,稳定正式版本和每周更新版本。选择每周版本,因为它包含最新功能和bug修复,推荐访问rosettacommons.org网站获取源代码。
安装Rosetta需要依赖OPENMPI与BOOST库。对于编译器,推荐使用Clang3.4.2,它不仅兼容C++11特性,且性能更佳。GCC版本8.21也能满足编译需求。确保使用mpiclang运行时,以避免干扰其他gcc编译环境。
编译多线程模式的Rosetta,例如利用40个核进行编译。测试安装后,确保Rosetta能正常运行。
PyRosetta是Python接口的Rosetta,提供多种安装方式。Release包编译较为直接,适合快速部署,但可能不兼容Anaconda。通过Anaconda源安装,步骤见jianshu.com/p/bc9b49930文章,此法完全兼容Anaconda环境。源代码编译则适用于Python2.7环境,注意需要大量内存以支持复杂编译过程。
Linux(CentOS 7_x64位)系统下安装RDkit
RDKit是一个开源工具包,专为化学信息学设计。本文将指导您在Linux CentOS 7_x64位系统下完成RDKit的安装。
为了顺利安装RDKit,您需要以下硬件环境:
在 CentOS 7.3(64位)系统上安装RDKit,首先确保具备兼容的硬件配置。
接下来是安装流程,分为几个关键步骤:
第一步:安装boost库,这是RDKit运行所需的依赖。
第二步:安装依赖包,确保所有必需的开发环境和工具已就位。
第三步:在/opt文件夹下执行RDKit的安装操作。
在安装完成后,请记得根据自己的安装路径调整环境变量设置。
最后,进行安装后的测试,以验证RDKit是否已成功安装并可正常运行。
在安装RDKit的过程中,您可能会遇到特定问题。请参考RDKit官方文档或社区论坛,寻求帮助与解决方案。