centos7 安装r centos7安装详细图解

大家好,今天来为大家解答centos7 安装r这个问题的一些问题点,包括centos7安装详细图解也一样很多人还不知道,因此呢,今天就来为大家分析分析,现在让我们一起来看看吧!如果解决了您的问题,还望您关注下本站哦,谢谢~

Rstudio Server的安装和使用(附常见问题)

在本地使用Rstudio有很多的限制,不能够长时间跑程序,而服务器上能够满足R的很多条件,通过在服务器端安装Rstudio能够和本地一样使用Rstudio。服务器的Rstudio Server通过浏览器输入IP地址完成。

注意:我这里使用的是centos 7,需要服务器的root权限。

1.1 Rstudio Server

1.2创建配置文件

1.3在防火墙配置文件中添加8787端口

1.4检查Rstudio-server是否能够运行并启动服务

1.5打开本地的浏览器,输入IP:端口号,会出现输入用户名和密码的提示。这里的用户名和密码就是每个用户自己的用户名和密码。

需要根据上面的步骤,打开rstudio的服务以及对应的网络端口。

2.1 RStudio Server安装完成后,浏览器无法打开ip:8787登录页,显示无法访问。

2.2 Rstudio server"Unable to connect to service"。在输入用户名和密码后,rstudio没有能够加载出来,并包以上出错。

2.3 Rstudio服务重启的问题。

rstudio-server有三个命令可以管理rstudio的服务

rstudio-server在重启的过程中,经常会遇到端口占用的问题,报错 Address already in use。这个错误是因为原有的进程占用已经设置好的端口,解决的方法是关闭所有占用该端口的进程。解决方案可以参考 这个网址。

2.3.1查看端口占用情况,这里我们是默认的8787端口

2.3.2结束对应的进程。这里关闭所有LISTEN相关的进程

至此,问题解决。

3参考网址

3.1

3.2

3.3

在CentOS系统上安装REMI仓库的方法

REMI仓库提供了CentOS和RHEL的核心包的更新版本,尤其是最新的PHP/MySQL系列(LCTT译注:当你需要一个更新包,而 CentOS/RHEL没有及时提供更新时, REMI仓库可以帮助你)。

安装REMI仓库要记住的一件事是不要在启用了REMI仓库时运行yum update。因为REMI仓库的包名与RHEL/CentOS中的相同,运行yum update可能会触发意外的更新。一个好办法是禁用REMI仓库,在你需要安装RMEI仓库中独有的包时再启用。

预备工作

安装REMI仓库之前,你首先需要启用EPEL仓库,因为REMI中的一些包依赖于EPEL。按照这份指南在CentOS或者RHEL中设置EPEL仓库。

安装REMI仓库

现在按照下面的步骤安装REMI仓库。

在CentOS 7上:

代码如下:

$ sudo rpm--import

$ sudo rpm-ivh

在CentOS 6上:

代码如下:

$ sudo rpm--import

$ sudo rpm-ivh

默认地,REMI是禁用的。要检查REMI是否已经成功安装,使用这个命令。你会看到几个REMI仓库,比如remi、remi-php55和remi-php56。

$ yum repolist disabled| grep remi

  从REMI仓库中安装一个包

如上所述,最好保持禁用REMI仓库,只有在需要的时候再启用。

要搜索或安装REMI仓库中的包,使用这些命令:

代码如下:

$ sudo yum--enablerepo=remi search

$ sudo yum--enablerepo=remi install

CentOS服务器网页版Rstudio-server及R包批量安装最佳实践

CentOS服务器网页版Rstudio-server及R包批量安装实践指南

在CentOS 7和8服务器上安装Rstudio-server并进行R包批量安装的步骤如下:

1.安装软件包

CentOS 7:执行相应的命令安装Rstudio-server所需的基础包。

CentOS 8:请确保您的系统已更新至最新版本,然后按照官方文档安装。

2.开放访问权限

为了通过网络访问Rstudio-server,需要在防火墙中开放8787端口。在CentOS 7和8中,分别执行:

CentOS 7: sudo firewall-cmd--permanent--add-port=8787/tcp

CentOS 8: sudo ufw allow'8787/tcp'

3.访问Rstudio-server

使用服务器的IP地址(例如192.168.1.10),在浏览器中输入:

使用提供的账号和密码登录Rstudio-server。

4.主题配置

登录后,您可以根据需要调整Rstudio-server的主题和界面设置。

5. R包管理

通过Rstudio-server,可以使用`Ctrl+ Shift+ N`快捷键新建Rscript,然后将R包列表(如800个包的列表)替换到`listOfPackages`变量中。参考生信技能树中的相关教程进行操作。

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