centos 安装r?centos安装步骤
在CentOS系统上安装REMI仓库的方法
REMI仓库提供了CentOS和RHEL的核心包的更新版本,尤其是最新的PHP/MySQL系列(LCTT译注:当你需要一个更新包,而 CentOS/RHEL没有及时提供更新时, REMI仓库可以帮助你)。
安装REMI仓库要记住的一件事是不要在启用了REMI仓库时运行yum update。因为REMI仓库的包名与RHEL/CentOS中的相同,运行yum update可能会触发意外的更新。一个好办法是禁用REMI仓库,在你需要安装RMEI仓库中独有的包时再启用。
预备工作
安装REMI仓库之前,你首先需要启用EPEL仓库,因为REMI中的一些包依赖于EPEL。按照这份指南在CentOS或者RHEL中设置EPEL仓库。
安装REMI仓库
现在按照下面的步骤安装REMI仓库。
在CentOS 7上:
代码如下:
$ sudo rpm--import
$ sudo rpm-ivh
在CentOS 6上:
代码如下:
$ sudo rpm--import
$ sudo rpm-ivh
默认地,REMI是禁用的。要检查REMI是否已经成功安装,使用这个命令。你会看到几个REMI仓库,比如remi、remi-php55和remi-php56。
$ yum repolist disabled| grep remi
从REMI仓库中安装一个包
如上所述,最好保持禁用REMI仓库,只有在需要的时候再启用。
要搜索或安装REMI仓库中的包,使用这些命令:
代码如下:
$ sudo yum--enablerepo=remi search
$ sudo yum--enablerepo=remi install
CentOS服务器网页版Rstudio-server及R包批量安装最佳实践
CentOS服务器网页版Rstudio-server及R包批量安装实践指南
在CentOS 7和8服务器上安装Rstudio-server并进行R包批量安装的步骤如下:
1.安装软件包
CentOS 7:执行相应的命令安装Rstudio-server所需的基础包。
CentOS 8:请确保您的系统已更新至最新版本,然后按照官方文档安装。
2.开放访问权限
为了通过网络访问Rstudio-server,需要在防火墙中开放8787端口。在CentOS 7和8中,分别执行:
CentOS 7: sudo firewall-cmd--permanent--add-port=8787/tcp
CentOS 8: sudo ufw allow'8787/tcp'
3.访问Rstudio-server
使用服务器的IP地址(例如192.168.1.10),在浏览器中输入:
使用提供的账号和密码登录Rstudio-server。
4.主题配置
登录后,您可以根据需要调整Rstudio-server的主题和界面设置。
5. R包管理
通过Rstudio-server,可以使用`Ctrl+ Shift+ N`快捷键新建Rscript,然后将R包列表(如800个包的列表)替换到`listOfPackages`变量中。参考生信技能树中的相关教程进行操作。
半分钟搞定Centos安装R4.3
在Linux系统上快速安装R4.3只需半分钟,让我们跟随经验丰富的邓飞逐步操作。R语言虽然看似简单,但安装过程需要耐心和正确的引导。首先,借助anaconda的miniconda环境,可以简化安装步骤,只需下载并配置好miniconda,激活环境后,便能轻松查看和安装不同版本的R语言。
找到4.3版本后,只需确认无误,点击安装即可。整个过程快速且流畅,半分钟内就能完成R语言的安装。这个过程中,对待R语言就像照顾小宝宝,需要细致和耐心。
如果你对GWAS分析有兴趣,推荐参加一个由经验丰富的分析师主讲的入门培训班。这个课程提供虚拟机安装的Linux环境,内置了R、Python等多个工具,涵盖了从基础到进阶的全部内容,包括GWAS分析所需的各种软件包,如Rstudio、GAPIT等。报名方式简单,扫描二维码即可参与,报名成功后还有福利赠送。
随着基因组学的发展,全基因组关联分析(GWAS)已成为科研人员必备技能。这个培训不仅能帮助你掌握GWAS的基本操作,还能提升你的数据处理和分析能力,让你在农业和医学领域的研究中游刃有余。立即行动,通过培训提升你的科研实力吧!